Skupina poslanců, která požadovala od vlády, aby stát rybářům opět vyplácel náhrady škod, které jim na rybách způsobují kormoráni, neuspěla. Vyplývá to z výsledků jednání vlády. Kormoráni, které rybáři pokládají za škodnou, nejsou od dubna zvláště chráněným druhem živočichů, což umožňuje jejich snazší odstřel. Stát ale zároveň nemusí vyplácet náhrady ztrát.
Podle názoru vlády nelze připustit, aby byl povolen plošný odlov a zároveň stále vyplácena kompenzace. Zákon se týká poskytování náhrad škod způsobených vybranými zvláště chráněnými druhy. Kormorán už podle vlády nenaplňuje znaky zvláště chráněného živočicha.
Právníci vlády tvrdí, že podle judikatury se volně žijící ryby ve vodě pokládají za "věc ničí" a že podle zákona o rybářství je možné si rybu přisvojit až jejím ulovením. To podle nich znamená, že škody na neulovených rybách se nedotýkají ničího vlastnického práva a není možné, aby za ně rybáři požadovali náhradu.
Skupina poslanců ze zemědělského výboru tvrdí, že při jednáních o vyřazení kormoránů z vyhlášky se debatovalo o novele zákona tak, aby stát poskytoval náhrady dál do doby, než se početní stavy těchto ptáků sníží na přijatelnou úroveň. Změnu ohledně kormoránů rybáři kritizovali. Poukazovali na to, že jediným zdůvodněním, proč kormorán zmizel z vyhlášky, byla úspora peněz za vyplácení škod. Rybáři by je měli nyní hradit ze svého. Namítají, že přemnožení ptáků způsobil stát.
Vláda také nesouhlasí s odhadovanou výší náhrad. Tvrdí, že v roce 2012 šlo o částku 41,3 milionu korun a že objem vyplácených náhrad narůstal. Například v roce 2007 vyplatil stát jen 26,5 milionu korun.
