Pozemkový fond ČR poskytuje náhrady oprávněným osobám za odstraněné a znehodnocené budovy a živý a mrtvý inventář smluvním převodem vlastnických práv k nemovitostem ve vlastnictví státu a správě fondu. Podle zákona o půdě se převádějí do vlastnictví oprávněných osob nemovitosti – budovy, stavby a pozemky jimi zastavěné, případně pozemky nezbytné k provozování těchto budov a staveb. Kromě toho se převádějí i pozemky nesouvisející s budovami či stavbami, které byly neúspěšně nabídnuty v rámci veřejné obchodní soutěže, a také jsou poskytovány finanční náhrady. Další formou poskytování náhrad jsou vzájemné zápočty pohledávek mezi oprávněnými osobami a Pozemkovým fondem ČR, například při úhradě kupní ceny privatizovaného majetku, při úhradě kupní ceny pozemků podle zákona o prodeji půdy, na nájemné a podobně. Informovala o tom mluvčí Pozemkového fondu ČR Lubomíra Černá.
K 31. prosinci 2010 činil objem nároků vůči Pozemkovému fondu ČR (podle §18a) 11 163,24 milionu korun, z toho bylo celkem vypořádáno 11 000,5 milionu korun. Odhad objemu nároků, které by měl Pozemkový fond ČR ještě převzít, je přibližně 0,2 miliardy korun. Podle § 17 odst. 3 písm. a) zákona o půdě Pozemkový fond ČR k 31. prosinci 2010 vypořádal smluvním převodem nemovitostí nároky oprávněných osob na náhrady ve výši 4,4 mld. korun. V období od roku 1993 do 31. 12. 2010 Pozemkový fond ČR celkem vypořádal nároky na náhrady smluvním převodem pozemků (včetně zápočtů pohledávek uplatněných při prodeji půdy) v hodnotě 980,5 milionu korun, což představuje 11 463,99 hekatrů smlouvami převedených pozemků.
Nároky oprávněných osob za nevydané pozemky jsou vypořádávány podle § 11a zákona o půdě smluvním bezúplatným převodem pozemků ve vlastnictví státu a správě Pozemkového fondu ČR, poskytnutím peněžité náhrady, zápočtem těchto nároků na kupní cenu pozemků prodávaných podle zákona o prodeji půdy a dále převádí Pozemkový fond ČR od roku 2001 nároky za nevydané lesní pozemky k plnění na Lesy ČR, s. p., a od 2. září 2003 na Vojenské lesy a statky, s. p.
Pozemkové úřady vydaly k 31. prosinci 2010 rozhodnutí o nevydání pozemků oprávněným osobám v hodnotě 7 852,1 mil. korun. Z toho k 31. 12. 2010 byly vypořádány nároky na pozemky podle § 11a zákona o půdě v hodnotě 7 048,49 mil. korun. Naturální formou bylo (včetně zápočtu pohledávek na prodej půdy) vypořádáno 5 171,81 mil. korun, což představuje celkem 98 665,71 ha smlouvami převedených pozemků. Finanční formou bylo vypořádáno 1 292,36 mil. korun, peněžitou náhradou (včetně zápočtů peněžité náhrady) bylo vypořádáno 560,48 mil. korun a na podniky lesů byly převedeny k vypořádání nároky oprávněných osob ve výši 18,22 mil. korun. Z toho vyplývá, že k rozsahu dosud rozhodnutých nároků pozemkovými úřady v hodnotě 7 852,1 mil. korun, dosáhlo plnění celých 89,77 %. Po 31. 12. 2010 eviduje Pozemkový fond ČR nevypořádaný zůstatek 803,61 milionu korun ze nevydané pozemky, což představuje 10,23 %.