Podle Petry Kolínské z odboru vnitřní a vnější komunikace Státního fondu pro životní prostředí bude možné z operačního programu Životní prostředí podpořit i výstavbu bioplynových stanic. Sloužit k tomu bude prioritní osa 3 udržitelné využívání zdrojů energie, ale netýká se to zatím první výzvy. Také v rámci prioritní osy 4 zkvalitnění nakládání s odpady a odstraňování starých ekologických zátěží je možné získat prostředky na bioplynové stanice pro zpracování bioodpadů. Půjde o stanice, které slouží převážně ke zpracování bioodpadů, tj. které zahrnují další systémové prvky svozu a třídění komunálního odpadu nebo svozu bioodpadů nebo doplňují již existující takový systém svozu a/nebo třídění.