Při poskytování a užití prostředků, kterými stát podporuje mimoprodukční funkce zemědělství, nebylo vše v pořádku.
Nejvyšší kontrolní úřad při kontrole zjistil porušování obecně závazných právních předpisů a některé systémové nedostatky. Výsledek úřad zveřejnil na internetových stránkách.
NKÚ prověřoval ministerstvo zemědělství, devět vybraných
zemědělských agentur MZe a 78 příjemců podpor, přičemž
kontrolovaným obdobím byly roky 2000 a 2001.
U MZe úřad zjistil nedostatky u zpracovaných žádostí, smluv a rozhodnutí. Například nebylo zřejmé, o jaký druh podpory jde. V některých případech byly dotace poskytovány na základě neúplných žádostí a dokladů a nedodržovaly se stanovené termíny. Resort také nevyhodnotil účinnost jednotlivých druhů programů ani to, jak peníze posloužily ke splnění stanovených cílů.
Příjemci čerpali podpory, i když nesplnili vždy závazky
uvedené v žádostech a neprokázali vždy právní důvod hospodaření na zemědělských pozemcích. Uváděli také nepravdivé údaje v čestných prohlášeních o splnění podmínek pro poskytnutí dotace. MZe podle Hugo Roldána z tiskového oddělení během kontroly NKÚ provedlo nebo zahájilo nápravná opatření.