Evropská unie poskytla v rámci Phare na posílení rostlinolékařské služby milión eur, tedy přibližně 35,25 miliónu korun. Polovina sumy půjde na pořízení diagnostické a laboratorní techniky. Podmínkou projektu modernizace fytosanitární diagnostiky je spolufinancování ve stejné výši ze strany ČR.
Podle informací ministerstva zemědělství by peníze, které vyčlení Česká republika, měly jít na zabezpečení provozu laboratorních kapacit v Olomouci a Praze- Ruzyni a také na vybavení terénních pracovišť Státní rostlinolékařské správy. Dále by z nich stát měl zaplatit obnovu vozového parku rostlinolékařské správy. Pokud ČR spolufinancování nezajistí, vzniká podle MZe reálné nebezpečí, že EK požádá o vrácení prostředků Phare pro neplnění podmínek českou stranou. Zvýšené a kvalitativně nové nároky na odbornou činnost rostlinolékařské správy a zejména její technické vybavení klade nová úprava fytosanitární legislativy, kterou představuje novela zákona o rostlinolékařské péči. Ta nově zavádí systém registrace pěstitelů, výrobců a dovozců vybraných druhů rostlin a rostlinných produktů, který je předpokladem postupného zavedení rostlinolékařských pasů užívaných v členských státech EU. Dále zpřísňuje ochranu území ČR před zavlečením nebezpečných škodlivých organismů rostlin.