Zklamání z legislativních návrhů reformy společné zemědělské politiky netají ani české ekologické organizace, i když připouštějí, že podle jejich mínění přináší řadu pozitivních prvků. Jak uvádějí ve svém společném prohlášení, přestože ozelenění přímých plateb je významným krokem vpřed, zůstává řada nejasností o začlenění jeho jednotlivých požadavků do zemědělské praxe. „Zejména bude nutné jasně určit, jaké plochy bude možné zahrnout mezi místa vymezená ochraně přírody a jaký způsob jejich využívání bude přijatelný,“ tvrdí ekologické nevládní organizace. Z jejich pohledu by tyto plochy měly zahrnovat například podmáčené sníženiny v polích, meze, hodnotné travní porosty a další specifické krajinné prvky. Tyto plochy mají velký potenciál zvýšit krajinnou pestrost, přispět ke snížení půdní i větrné eroze a zadržet vodu v krajině. Mohou také podpořit pestrost rostlin a živočichů v evropské přírodě, tvrdí ekologové.
Za největší hrozbu v návrhu z pohledu ochrany přírody považují platby vázané na produkci některých plodin, aniž by bylo ze zdůvodnění Evropské komise zřejmé, proč je nárůst produkce žádoucí. V té souvislosti upozorňují například na stále rostoucí výměru kukuřice a řepky olejky. Problematický je podle nich také návrh, aby malé farmy nemusely plnit minimální požadavky na ochranu životního prostředí a zdraví.
„Ekologické nevládní organizace vnímají zemědělství jako jedno z klíčových odvětví při ochraně evropské přírody i krajiny a apelují na jasné nastavení standardů společné zemědělské politiky. Jedině pevné standardy totiž zajistí, že daně Evropanů budou podporovat pouze zemědělství, které povede ke zdravé a trvale udržitelné budoucnosti životního prostředí i nás samých,“ stojí ve zmíněném prohlášení.
„Evropskému zemědělství plyne velká část unijního rozpočtu. Daňoví poplatníci by si měli být jistí tím, že své peníze dávají do zemědělství, které přinese zdravé a šetrně vyprodukované potraviny a kvalitní životní prostředí jim i jejich dětem. Podmínění pouhé třetiny přímých plateb kvalitnějším a šetrnějším zemědělským hospodařením považujeme za první krok na cestě k udržitelnému zemědělství. Někteří představitelé českého ministerstva zemědělství bohužel proti této pozitivní změně brojí,“ poznamenal Daniel Vondrouš z asociace nevládních organizací Zelený kruh. „V návrhu chybí také podpora postupného přechodu od intenzivní živočišné produkce k udržitelným a humánním způsobům chovu hospodářských zvířat. Zachovány naopak zůstávají finanční náhrady vyplácené za export živého skotu na chov do mimoevropských zemí. Zásadně nesouhlasíme s dotační podporou dálkové přepravy živých zvířat,“ prohlásila Romana Šonková z organizace Compassion in World Farming.