Ministr zemědělství Jaroslav Palas rozhodl o vytvoření jedné platební agentury, která bude žádat o akreditaci pro všechny druhy plateb v resortu zemědělství. Toto řešení doporučily i orgány Evropské unie. Vznik této platební agentury byl již v době nástupu ministra zemědělství Jaroslava Palase do funkce zpožděn.
Nyní jde o to dosáhnout její akreditace tak, aby nebyla ohrožena administrace zhruba 24 miliard korun, které má už v příštím roce získat agrární sektor z fondů Evropské unie a státního rozpočtu ČR.
Na budování jednotlivých částí informačního systému pro platební agenturu byly v minulosti uzavřeny jednotlivé smlouvy s různými dodavateli.
V letošním roce byla v rámci twiningových jednání problematika informačního systému konzultována s úředníky Evropské komise a ti doporučili přizvat ke spolupráci pracovníky některé z platebních agentur zemí EU. Na základě těchto jednání se pracovníci MZe spojili s experty rakouské platební agentury AGRAMARKT AUSTRIA. Ve spolupráci s nimi pak byla provedena hloubková analýza stávajících informačních systémů.
Tato analýza byla dokončená letos v létě a odhalila a mimo jiné upozornila na to, že některé prvky systému nefungují jako celek a nejsou vzájemně provázané. Řešením bylo najít firmu, která chybu a tyto nedostatky odstraní.
Protože česká platební agentura má podle harmonogramu požádat o akreditaci koncem letošního roku, nebylo možné postupovat klasickým výběrovým řízením. Včasná akreditace platební agentury by s ohledem na zákonem stanovené lhůty klasického výběrového řízení mohla být ohrožena. V souladu se zákony proto byla oslovena renomovaná auditorská firma BDO CS, aby vybrala vhodného uchazeče, který informační systém sjednotí. BDO oslovila sedm renomovaných firem a na základě jimi předložených nabídek doporučila firmu SAP ČR spol s r.o. Tato nyní zpracovává svůj návrh řešení s konkrétní cenovou nabídkou a chystá se jej předložit. Dosud vybudované systémy budou pochopitelně do budoucího celkového informačního systému včleněny. Firma SAP je dodavatelem programového vybavení několika zemědělských platebních agentur v členských i kandidátských zemích EU.
Veškerá práce platební agentury včetně práce jejího informačního systému podléhá plné kontrole evropských institucí v Bruselu a také kontrole Ministerstva zemědělství, Ministerstva financí a NKÚ ČR.