Novou roli dává schválená reforma společné zemědělské politiky odbornému poradenství. I když zatím podrobnou směrnici unie nevydala, je zřejmé, že od roku 2007 bude muset každý členský stát EU svým zemědělcům zajistit poradenský systém. Ten by minimálně měl zahrnout oblast zákonných požadavků, které musí zemědělci při svém hospodaření splnit.
Podle Martina Mistra z Ústavu zemědělských a potravinářských informací by mělo jít zejména o oblast zdraví veřejnosti, hospodářských zvířat a rostlin, oblast životního prostředí a oblast péče o hospodářská zvířata (animal welfare) Tento požadavek unie souvisí s pravidlem známým z reformy SZP jako cross compliance (vázaná podmíněnost). Její podstatou je podmínění plateb poskytnutých zemědělcům dodržením zákonných požadavků na hospodaření a respektování 18 právních předpisů EU, které budou postupně nabývat činnost. Je možné, že takto orientované poradenství bude po roce 2010 povinné pro podniky, které budou ročně dostávat více než 15 000 eur přímých plateb. Zatím Brusel pouze požaduje, aby členské státy těmto subjektům zajistily k poradenství přednostní přístup. Rozcvičkou tohoto poradenského systému je letošní dotační titul 9 F, který počítá s 25 miliony korun. Týká se poradenských služeb v oblasti dodržování právních předpisů vycházejících ze Směrnic EU v oblasti ochrany vod, welfare zvířat a přechodu z konvenčního na ekologický způsob hospodaření u žadatelů, kteří mají k 1. 1. 2004 všechny pozemky v ekologickém zemědělství zařazeny do přechodného období. Přestože počítá s možností uhradit zemědělcům až 80 procent nákladů, skutečná výška úhrady bude samozřejmě záviset na zájmu o tento dotační titul. "Vzhledem k výši finančních prostředků nebude podporováno technologické a ekonomické poradenství, jehož účelem je zvýšení zisku podniku," připomněl Mistr.
Podle záměru nové koncepce poradenského systému by se měla částka vyčleněná na dotaci poradenství každoročně zvyšovat, pravděpodobně na 50 mil. v příštím roce a na 75 milionů v roce 2006. Pokud bude účast v poradenském systému pro všechny zemědělce dobrovolná, je samozřejmě obtížné předem odhadnout, kolika subjektům bude od roku 2007 opravdu sloužit. Koncepce MZe předpokládá, že půjde již o deset až dvanáct tisíc podniků a že se jejich počet bude každoročně zvyšovat. V roce 2007 by podle ministerstva mělo být k zajištění poradenského systému zapotřebí 140 milionů korun a zapojit by se do něj mělo alespoň 175 akreditovaných poradců na plný úvazek. Řídícím orgánem nového poradenského systému bude MZe, ústřední kontrolu a informační zázemí bude zajišťovat ÚZPI. K tomu bude třeba již letos transformovat státní poradenskou síť a zajistit propojení a úzkou spolupráci se zemědělskými agenturami, agrární komorou, svazy a v současné době vznikajícími zemědělskými informačními a poradenskými centry.