Podle Hospodářských novin byli vítězové výběrového řízení, kteří od státu získají monopol na výrobu biolihu, známi už před tím, než je vybrala komise a schválil ministr životního prostředí Libor Ambrozek. Deník totiž předpokládané vítěze zveřejnil ještě před jeho rozhodnutím, protože získal informace, že je vlivní podnikatelé prosadí bez ohledu na jednání komise. Vítězové prvního kola květnového výběru pak skutečně byli s předem označenými firmami shodní.
Podle analýzy právnické firmy Kocián Šolc Balaštík je tendr založený na principu kvót diskriminační, představuje ilegální státní pomoc a je v rozporu se dvěma ze čtyř základních práv Evropské unie. Jde o práva na poskytování služeb a na volný pohyb zboží. Firmy vyřazené z tendru, například Cukrovary TTD, nyní chystají žaloby,
ekonomové poukazují na vytváření korupčního prostředí, odpovědní politici však žádnou chybu nevidí. Tendr kritizuje i Agrární komora ČR. Podle prezidenta komory Jana Veleby byly v prvním kole tendru nepochopitelně vyřazeny firmy, které jsou spojeny se zemědělci. „Producentům obilí nemá být umožněn naprosto přirozený kapitálový vstup do tohoto typu zpracovatelského průmyslu. Ve vyspělých agrárních soustavách jsou zemědělci majetkově spjati se zpracovatelským průmyslem. Nechápu, proč u nás je nám v tomto bráněno,“ řekl minulý týden. Ministerstvo životního prostředí reagovalo vzkazem, že ministr Ambrozek je připraven se zástupci AK jednat.