Od roku 1999 dělá veterinární správa tzv. pasportizaci (hodnocení) provozů, které zpracovávají živočišné suroviny. První stupnice vznikla již v květnu zmíněného roku a měla tři hlavní kategorie – A, B a C, které se dále členily na první až třetí podskupinu. Zatímco v nejlepší skupině A1 byl provoz, který legislativě EU zcela a bez závad vyhovoval, do poslední skupiny označené B3 se dostal ten, který požadavky nesplňoval a bylo jasné, že pokud se radikálně nezlepší, nemá perspektivu. Podle Milana Maleny ze Státní veterinární správy ČR se veterináři do poloviny roku 2001 „definitivně vypořádali“ s provozy, které spadly do zmíněné poslední kategorie.
Do tohoto data buď ukončily svou činnost, nebo se zlepšily a posunuly se do nějaké vyšší kategorie. Sama SVS ke zmíněnému datu zavřela 17 subjektů, 43 skončilo dobrovolně a 51 se posunulo nejméně o stupínek výš. Do konce roku 2001 přestaly existovat provozy, která veterináři hodnotili jako C2 (67 z vlastního rozhodnutí, veterináři zavřeli brány dalších 22 a 227 se zachránilo postupem na další příčky žebříčku). V roce 2001 přišly stejným způsobem na řadu provozy ze škatulky C1. Jak Malena uvedl, na přelomu let 2002 a 2003 se tempo příprav zvýšilo a ukázalo se, že je nutné způsob pasportizace přepracovat v souladu se závěry misí inspektorů z EU. Vznikly nové kategorie, v nichž písmeno V znamenalo, že subjekt musí splnit požadavky EU a má velkou kapacitu, M – požadavky EU, ale malá kapacita a skutečnost, že podnik bude žádat o úlevy (možnost obchodování jen na lokálním trhu). Pod písmenem Q jsou subjekty s malou kapacitou, které splní požadavky EU stejně jako velkokapacitní. X se vztahuje na podniky, jichž se bez rozlišení kapacity týkají požadavky EU. Pro subjekty, které mají splnit národní požadavky jsou další tři písmena, a to S pro velkou kapacitu, P pro malou a Y pro provozy s s nerozlišenou kapacitou. K těmto písmenům přiřazené číslovky 1 až 5 specifikují, zda jde o provoz vynikající, velmi dobrý, dobrý, vyhovující či nevyhovující. Ze scény postupně, ať již kvůli veterinářům, nebo pod ekonomickým tlakem vypadávají další podniky. Jiné se již na podmínky EU plně adaptovaly. K polovině letošního roku to bylo 534 subjektů.